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杨 弋    
杨弋,1973年生,博士,教授,生物反应器工程国家重点实验室副主任,长江学者特聘教授。1995毕业于清华大学生物科学与技术系;1997、1999年分别获清华大学生物化学硕士和博士学位。1999-2004年相继在哈佛大学医学院与波士顿大学医学院进行博士后研究工作。2005年任哈佛医学院生物化学副研究员及医学讲师。2006年回国工作任华东理工大学特聘教授,博士生导师。先后入选教育部新世纪优秀人才计划,上海市浦江人才计划。2012年获国家杰出青年基金资助,2017年入选国家万人计划科技创新领军人才。现为中国生物化学与分子生物学会理事,中国细胞生物学会理事,中国生化学会酶学专业委员会副主任、秘书长,上海市细胞生物学学会副理事长、上海市生物化学与分子生物学学会副理事长。主持国基金重点项目、科技部重点研发计划等国家项目及上海市科委科学创新行动计划等省部级项目。欢迎在本实验室研发的前沿生物技术基础上的各种形式科研合作。
主要研究方向及内容

1、神经递质与细胞代谢物的遗传编码荧光探针

通过理性设计手段将小分子结合蛋白与荧光蛋白相融合,发展针对重要神经递质及核心细胞代谢物的探针。进一步在脑认知功能的神经基础、脑疾病机理与诊断等研究中应用这些探针,发现神经活动过程中神经递质释放、分布与消除的特征,及神经细胞与胶质细胞能量代谢及其相互作用的的规律。

2、生物大分子标记及相互作用分子探针

将发展化学标记与遗传技术相结合的新原理,发展特异性的蛋白质、RNA化学标记,进一步发展高响应、实时动态的生物大分子构象、相互作用分子探针与成像技术。进一步在神经发育、学习与记忆等神经活动等过程中研究神经递质结合诱导的受体构象变化、重要信号转导蛋白质的相互作用的实时追踪。

3、蛋白质水平与活性调控的光遗传学技术

系统发展光可控功能蛋白质的设计与筛选方法,获取具有高诱导,低泄漏,不同光敏感性、激活与恢复动力学参数的优质光敏的转录因子、RNA酶、蛋白质降解子、蛋白质转位子等,实现在不同层次上对蛋白质表达水平与功能的动态调控。利用这些技术研究神经发育、学习与记忆等神经活动中较长时间尺度(如小时或天)上功能基因的作用。

代表性论文

Zou Y, Wang A, Huang L, Zhu X, Hu Q, Zhang Y, Chen X, Li F, Wang Q, Wang H, Liu R, Zuo F, Li T, Yao J, Qian Y, Shi M, Yue X, Chen W, Zhang Z, Wang C, Zhou Y, Zhu L, Ju Z, Loscalzo J, Yang Y*, and Zhao Y*. Illuminating NAD+ Metabolism in Live Cells and In Vivo Using a Genetically Encoded Fluorescent Sensor. Developmental Cell 2020, 53, 240-252.

Li X, Zhang C, Xu X, Miao J, Yao J, Liu R, Zhao Y, Chen X* and Yang Y*, A single-component light sensor system allows highly tunable and direct activation of gene expression in bacterial cells, Nucleic Acids Research. 2020, 48, e33.

Zhang Z, Cheng X, Zhao Y and Yang Y, Lighting Up Live-Cell and In Vivo Central Carbon Metabolism with Genetically Encoded Fluorescent Sensors, Annu Rev Anal Chem 2020, 10.1146/annurev-anchem-091619-091306

Chen X, Zhang D, Su N, Bao B, Xie X, Zuo F, Yang L, Wang H, Jiang L, Lin Q, Fang M, Li N, Hua X, Chen Z, Bao C, Xu J, Du W, Zhang L, Zhao Y, Zhu L*, Loscalzo J and Yang Y*, Visualizing RNA dynamics in live cells with bright and stable fluorescent RNAs, Nature Biotechnology, 2019, 37,1287-1273.

Hao X, Gu H, Chen C, Huang D, Zhao Y, Xie L, Zou Y, Shu HS, Zhang Y, He X, Lai X, Zhang X, Zhou BO, Zhang CC, Chen GQ, Yu Z*, Yang Y* and Zheng J*, Metabolic Imaging Reveals a Unique Preference of Symmetric Cell Division and Homing of Leukemia-Initiating Cells in an Endosteal Niche, Cell Metabolism 2019, 4, 950-965.

Zou Y, Wang A, Shi M, Chen X, Liu R, Li T, Zhang C, Zhang Z, Zhu L, Ju Z, Loscalzo J, Yang Y* and Zhao Y*, Analysis of redox landscapes and dynamics in living cells and in vivo using genetically encoded fluorescent sensors, Nature Protocols 2018, 13, 2362-2386.

Tao R, Zhao Y, Chu H, Wang A, Zhu J, Chen X, Zou Y, Shi M, Liu R, Su N, Du J, Zhou HM, Zhu L, Qian X, Liu H*, Loscalzo J and Yang Y*, Genetically encoded fluorescent sensors reveal dynamic regulation of NADPH metabolism, Nature Methods 2017, 14(7): 720-728.

Zhao Y, Wang A, Zou Y, Su N, Loscalzo J, Yang Y*. In vivo monitoring of cellular energy metabolism using a highly responsive sensor for NAD+/NADH redox state. Nature Protocols 2016, 11(8), 1345-1359

Chen X, Li T, Liu R, Ma Z, Xu X, Zhang H, Xu J, Ouyang Q, Yang Y*. An extraordinary stringent and sensitive light switchable gene expression system for bacterial cells. Cell Research 2016,26:854-857

Chen X, Li T, Wang X, Du Z, Liu R, and Yang Y*. Synthetic dual-input mammalian genetic circuits enable tunable and stringent transcription control by chemical and light. Nucleic Acids Res 2016, 44(6), 2677–2690.

Zhao, Y., Hu, Q., Cheng, F., Su, N., Wang, A., Zou, Y., Hu, H., Chen, X., Zhou, H.M., Huang, X., Yang, K., Zhu, Q., Wang, X., Yi, J., Zhu, L., Qian, X., Chen, L., Tang, Y., Loscalzo, J., and Yang, Y*. SoNar, a Highly Responsive NAD(+)/NADH Sensor, Allows High-Throughput Metabolic Screening of Anti-tumor Agents. Cell Metabolism 2015, 21, 777-789.

Wang, X., Chen, X., and Yang, Y. *  Spatiotemporal control of gene expression by a light-switchable transgene system. Nature Methods 2012, 9, 266-269.

Huang, C., Yin, Q., Zhu, W.*, Yang, Y. *, Wang, X., Qian, X., and Xu, Y.*  Highly Selective Fluorescent Probe for Vicinal-Dithiol-Containing Proteins and In Situ Imaging in Living Cells. Angew Chem Int Ed Engl 2011, 123, 7693-7698.

Zhao, Y., Jin, J., Hu, Q., Zhou, H.M., Yi, J., Yu, Z., Xu, L., Wang, X., Yang, Y. *, and Loscalzo, J. Genetically Encoded Fluorescent Sensors for Intracellular NADH Detection. Cell Metabolism 2011, 14, 555-566.

Yang, Y., Song, Y., and Loscalzo, J. Regulation of the protein disulfide proteome by mitochondria in mammalian cells. Proc Natl Acad Sci U S A 2007, 104, 10813-10817.

Yang, Y., and Loscalzo, J. S-nitrosoprotein formation and localization in endothelial cells. Proc Natl Acad Sci U S A 2005, 102, 117-122.

Yang, Y., Maret, W., and Vallee, B.L. Differential fluorescence labeling of cysteinyl clusters uncovers high tissue levels of thionein. Proc Natl Acad Sci U S A 2001, 98, 5556-5559.

实验室网址:http://pharmacy.ecust.edu.cn/2008/1203/c2800a29434/page.htm
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